发表在《癌细胞》杂志上的数据展示了头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)可能的新治疗方案,并详细阐述了人类乳突病毒(HPV)阴性HNSCC中关键癌症相关基因、磷酸化位点和信号通路的作用。
该数据系统地记录了有关该疾病的信息,通过多组学分析确定了3种不同的亚型,这些亚型通过相应的可用疗法有较高的治疗潜力。
研究人员写道:“这项研究增加了我们对HPV阴性HNSCC的生物学理解,并产生了治疗假设,这些假设可能作为未来临床前研究和临床试验的基础,以期实现对这种侵袭性癌症进行分子引导的精准治疗。”
三种亚型
第一种亚型被称为“CIN”,代表“染色体不稳定”,被认为预后最差。它与喉部、吸烟史和染色体不稳定性增加有关。研究小组认为,鉴于其与CCND1和CDKN2A基因畸变以及CDK4和CDK6酶的高活性有关,因此这种癌症亚型对CDK4/6抑制剂治疗的反应最好。
研究人员在发现的第二种亚型中,发现了基础因子的一些蛋白质升高,因此该亚型被称为“基础亚型”。这些代表了基因转录激活所必需的最基本的蛋白质。该亚型具有EGFR信号通路高活性,并且也有AREG和TNFA分子高表达。因此研究人员认为,靶向EGFR的单克隆抗体是该亚型的最佳治疗方法。
最后一种亚型被称为“免疫亚型”,是在不吸烟的患者中发现的,具有多种免疫检查点蛋白的高表达。数据表明,这种亚型的患者对免疫检查点抑制剂的反应最好。
总体数据显示,32%的CIN亚型患者、62%的基础亚型患者和83%的免疫亚型患者具有较高的治疗反应潜力。
试验分析
该试验的主要研究者、约翰霍普金斯大学医学院生物标志物发现和翻译中心主任Daniel Chan博士说:“这项研究增加了我们对HPV阴性HNSCC的生物学理解,并产生了治疗假设,这些假设可能作为未来临床前研究和临床试验的基础,以期实现对这种侵袭性癌症进行分子引导的精准治疗。”
研究小组还确定了EGFR有两种激活模式。该发现意味着有了一种基于与EGFR结合的分子数量来将这种癌症类型进行分层的潜在新方法。此外,研究人员得出结论,产生免疫应答能力的丧失归因于免疫调节基因的广泛缺失。
来自美国和波兰的研究人员分析了110例未经治疗的原发性HNSCC肿瘤和匹配的血液样本。共有66个肿瘤与正常邻近组织相匹配。
总结
研究人员总结说:“我们已经在公开的数据库和门户网站上上传了原始数据集和已处理的数据集,让HNSCC学界和更广泛的科学界可以全面调查这一具有广泛特征的队列。我们还期望该已证实的蛋白质基因组学框架能够广泛应用于HNSCC和其他癌症类型的未来研究。”
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